108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8667 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  58.33 
 
 		 277 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  49.1 
 
 		 279 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  34.98 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  35 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  35.09 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  34.04 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  37.13 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.28 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  32.07 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.52 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.49 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  33.02 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.53 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  28.69 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  28.85 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.39 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  30.17 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.97 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  22.95 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.69 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  24.19 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  24.38 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  24.38 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.26 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.28 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>