182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0364 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  100 
 
 
312 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  65.11 
 
 
278 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  56.88 
 
 
278 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  56.16 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  55.8 
 
 
276 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  53.43 
 
 
277 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
279 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
283 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  34.28 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  33.9 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  34.32 
 
 
291 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
285 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.94 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
291 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  31.71 
 
 
285 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
287 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  33.47 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  33.62 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
297 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  29.01 
 
 
283 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
286 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  31.02 
 
 
287 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  33.19 
 
 
289 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  32.77 
 
 
289 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
294 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
287 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  30.04 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  32.34 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.64 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
295 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
291 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  30.04 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.33 
 
 
278 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
286 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.35 
 
 
270 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.04 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.02 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
288 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  30.1 
 
 
281 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.08 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  32.08 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  28.63 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
287 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
293 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.54 
 
 
331 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
288 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
265 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
283 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.88 
 
 
282 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
282 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
269 aa  86.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
277 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.2 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.73 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  23.69 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  21.37 
 
 
387 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.64 
 
 
283 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.01 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>