88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3599 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  100 
 
 
288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  56.75 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  48.62 
 
 
287 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  34.85 
 
 
277 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
279 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  32.44 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
291 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
286 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
312 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
295 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.69 
 
 
287 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.58 
 
 
279 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
299 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
279 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.69 
 
 
288 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.21 
 
 
289 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  30.21 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  26.36 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
297 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
278 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.46 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.04 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  24.65 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.88 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  24.62 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.26 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  20.31 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
293 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  25.15 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  23.33 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  23.12 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  22.6 
 
 
281 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  22.16 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  25 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  25 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  21.64 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  21.19 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  20.35 
 
 
285 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.56 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  22.09 
 
 
387 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
402 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>