196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3105 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  100 
 
 		 317 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  41.85 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  40.37 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  40.31 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  42.59 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  37.54 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  39.45 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  39.6 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  38.08 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  39.79 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  37.42 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  40.25 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  36.92 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  39.18 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  34.53 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  35.31 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  33.67 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  34.86 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  35.29 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  28.72 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.41 
 
 		 381 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.72 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.39 
 
 		 341 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.65 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  30.12 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.47 
 
 		 629 aa  92.8  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.62 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.39 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.18 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.62 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.55 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.21 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.24 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.58 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.98 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.5 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.59 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  27.12 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.54 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  23.51 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  23.21 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.46 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.92 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.1 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  21.81 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.25 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.9 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>