123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0158 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 
346 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  67.85 
 
 
351 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
333 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  33.84 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.12 
 
 
342 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  31.21 
 
 
629 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  36.76 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.93 
 
 
342 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  32.93 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.55 
 
 
323 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
372 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.66 
 
 
350 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  31.74 
 
 
361 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.06 
 
 
339 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
334 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.93 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.81 
 
 
339 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
358 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.48 
 
 
337 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.51 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
364 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
350 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.33 
 
 
330 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.89 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.43 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
291 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.76 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  30.09 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.71 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  24.55 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  23.8 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  23.92 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.04 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.02 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
358 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  22.66 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.1 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
389 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  23.19 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  20.49 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.39 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
397 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
413 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  23.26 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.88 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
409 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  30 
 
 
305 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>