126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0715 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  100 
 
 		 421 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  82.9 
 
 		 421 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  82.1 
 
 		 433 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  58.25 
 
 		 420 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  57.77 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  55.42 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  55.42 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  55.42 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  55.34 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  55.58 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  50.12 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  48.7 
 
 		 435 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  50.24 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  50 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  48.94 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  47.82 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  47.82 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  47.73 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  47.73 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  47.73 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  46.67 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  42.54 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  42.82 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  43.35 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  41.23 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  39.47 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  38.14 
 
 		 402 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  37.6 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  36.9 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  37.69 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  36.9 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  35.66 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  35.47 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.61 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  29.19 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  38.54 
 
 		 206 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  49.58 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.93 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  21.3 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  20.98 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.04 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.04 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  27.78 
 
 		 345 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.33 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  21.63 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  20.6 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.64 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.69 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  20.84 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.32 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.42 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.78 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  20.56 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  20.51 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>