117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4134 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  98.23 
 
 
396 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  98.23 
 
 
396 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  100 
 
 
396 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  99.24 
 
 
396 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  98.74 
 
 
396 aa  805    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  61.99 
 
 
392 aa  534  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  62.76 
 
 
392 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  63.97 
 
 
396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  62.95 
 
 
396 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  61.36 
 
 
394 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  62.27 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  56.74 
 
 
400 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  54.95 
 
 
409 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  53.51 
 
 
409 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  53.51 
 
 
409 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  53.77 
 
 
409 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  53.4 
 
 
409 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  42.67 
 
 
395 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  41.97 
 
 
409 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  42.56 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
413 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
392 aa  282  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  36.68 
 
 
408 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  34.28 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
401 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
401 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
415 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  37.05 
 
 
401 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  31.99 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
404 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
398 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
391 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
391 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.68 
 
 
398 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.26 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
398 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.03 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
447 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  21.91 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  21.49 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  21.45 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.2 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  21.94 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  20.22 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  20.35 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  21.63 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  20.99 
 
 
421 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  21.04 
 
 
399 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  20.39 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  20.39 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  20.39 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  20.33 
 
 
420 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
330 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.67 
 
 
629 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.62 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
353 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  23.4 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.56 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  24.53 
 
 
297 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>