146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4590 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  100 
 
 
390 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  70.18 
 
 
388 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  56.71 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  43.46 
 
 
431 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  42.89 
 
 
432 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  42.89 
 
 
432 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  42.89 
 
 
432 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  43.46 
 
 
447 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  43.46 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  43.46 
 
 
435 aa  318  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  42.71 
 
 
401 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  43.01 
 
 
429 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  42.01 
 
 
426 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  42.01 
 
 
426 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  40.59 
 
 
402 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  40.31 
 
 
444 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  41.97 
 
 
428 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  38.46 
 
 
437 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  38.66 
 
 
437 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  40.16 
 
 
437 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  39.9 
 
 
398 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  39.39 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
421 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
433 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  37.98 
 
 
420 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  38.08 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  38.08 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  38.08 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  39.02 
 
 
420 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  39.28 
 
 
418 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  37.69 
 
 
421 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
421 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  37.56 
 
 
402 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
393 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
374 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  32.31 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
391 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
403 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
397 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
378 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
391 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.53 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  36.95 
 
 
206 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
399 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  29 
 
 
441 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
378 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
372 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  28.9 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  40.29 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
389 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
390 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
390 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
390 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
405 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
395 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
409 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  30.04 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  21.59 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  21.55 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.74 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  22.05 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  21.24 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.34 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  28.27 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>