153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  100 
 
 		 441 aa  898    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  29 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  29 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.83 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  28.61 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 429 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 374 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  25.98 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  29.81 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  30.09 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  25 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 397 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 402 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  22.78 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  30.49 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  28.24 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  25.06 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.62 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.28 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 392 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 325 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 354 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 396 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.9 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.05 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>