128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2359 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  100 
 
 
404 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  46.7 
 
 
399 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  38.19 
 
 
392 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
398 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
415 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  34.91 
 
 
401 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  34.91 
 
 
401 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  34.91 
 
 
401 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
404 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  36.05 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  35.75 
 
 
396 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  35.63 
 
 
396 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
396 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
396 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  33.59 
 
 
395 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
396 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
396 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  33.91 
 
 
396 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
392 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
396 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  32.5 
 
 
392 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
409 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  30.62 
 
 
413 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
413 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  31 
 
 
400 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
409 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
409 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
409 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
409 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
378 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
362 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
391 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
397 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.45 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.47 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.39 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  25 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  21.91 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  27.91 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
320 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.14 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  25 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  22.2 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
447 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
435 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.82 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.78 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
441 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>