109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2489 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  93.68 
 
 
380 aa  747    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  93.68 
 
 
380 aa  747    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  95.26 
 
 
380 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  93.95 
 
 
380 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  100 
 
 
380 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  32.7 
 
 
386 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
393 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  33.8 
 
 
365 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  30.11 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
370 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
377 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
370 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
370 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
370 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  30.18 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.79 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
372 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
347 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
392 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  28.19 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.28 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  29.49 
 
 
410 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  25 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  25 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  25 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.2 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  22.49 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  27.84 
 
 
440 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
396 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.35 
 
 
338 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
404 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  20.96 
 
 
335 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.71 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.11 
 
 
339 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
326 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  21.91 
 
 
326 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  22.5 
 
 
444 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  22.47 
 
 
428 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>