49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3698 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  100 
 
 
370 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  100 
 
 
370 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  85.64 
 
 
377 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  86.87 
 
 
370 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  100 
 
 
370 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
380 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
380 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
380 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
347 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
380 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
386 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  31.03 
 
 
366 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  29.79 
 
 
365 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25 
 
 
378 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  22.73 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
339 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.51 
 
 
339 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  23.68 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  21.25 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
409 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
351 aa  46.2  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  20.62 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.3 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
444 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.48 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>