132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1774 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  100 
 
 
401 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  100 
 
 
401 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  88.69 
 
 
415 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  99.75 
 
 
401 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  88.01 
 
 
408 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  55.56 
 
 
392 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  41.12 
 
 
404 aa  306  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  40.7 
 
 
409 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
395 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
396 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  38.23 
 
 
396 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
409 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  39.2 
 
 
409 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  38.15 
 
 
396 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  38.64 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  38.64 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  37.84 
 
 
394 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
400 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  39.19 
 
 
392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  38.27 
 
 
392 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
396 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
396 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  37.05 
 
 
396 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  37.05 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  37.05 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  37.06 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
409 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  34.61 
 
 
413 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  34.91 
 
 
404 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
398 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
410 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  21.98 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.64 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.71 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.11 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  22.47 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  21.75 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  21.04 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
400 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.75 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  22.49 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  20.33 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  20.33 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
380 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.1 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
357 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.98 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  20.93 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25 
 
 
293 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
342 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  20.33 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>