182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4454 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  100 
 
 
393 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  38.5 
 
 
395 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  37.19 
 
 
403 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  37.44 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  36.41 
 
 
391 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
391 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  33.5 
 
 
391 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
388 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
444 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
426 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
426 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  30.03 
 
 
400 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  31.96 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  28.61 
 
 
421 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  30.85 
 
 
432 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  30.85 
 
 
432 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  30.85 
 
 
432 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
437 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
401 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
429 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  31.01 
 
 
434 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  30.75 
 
 
431 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  30.49 
 
 
447 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  26.79 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
402 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
418 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
435 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  28.13 
 
 
420 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  29.32 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.72 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  28.27 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
421 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
420 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
420 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
420 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.68 
 
 
378 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
420 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
399 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
378 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  28.61 
 
 
414 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
387 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
389 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.94 
 
 
429 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
441 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  32.35 
 
 
206 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  39.5 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.9 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.84 
 
 
629 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.56 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.73 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.12 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  22.27 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>