73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5384 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  53.77 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  38.64 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  38.64 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  38.64 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  39.02 
 
 		 437 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  37.84 
 
 		 444 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  36.45 
 
 		 437 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  63.25 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  63.25 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  52.5 
 
 		 429 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  52.89 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  52.89 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  51.24 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  52.07 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  46.4 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  45.45 
 
 		 437 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  48.36 
 
 		 402 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  49.58 
 
 		 421 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  51.64 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  43.85 
 
 		 433 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  44.27 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  45.6 
 
 		 421 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  50 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  41.67 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  47.54 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  44.27 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  44.27 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  43.7 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  43.7 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  49.57 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  43.7 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  46.09 
 
 		 390 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  43.44 
 
 		 402 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  39.5 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  40.78 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  32.52 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.69 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  34.55 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  21.83 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  21.37 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  32.71 
 
 		 392 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 398 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 396 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  28 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.5 
 
 		 350 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  32.58 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>