149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2579 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  100 
 
 
426 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  100 
 
 
426 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  59.52 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  57.69 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  57.69 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  57.69 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  56.52 
 
 
429 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  55.4 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  56.14 
 
 
431 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  56.07 
 
 
435 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  55.1 
 
 
434 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  51.52 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  49.88 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  48.54 
 
 
433 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  47.82 
 
 
421 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  47.33 
 
 
421 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  48.75 
 
 
444 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  47.09 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  45.43 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  45.43 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  45.43 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  46.6 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  45.68 
 
 
421 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  45.19 
 
 
420 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
437 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  43.68 
 
 
388 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  43.01 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  41.75 
 
 
390 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.27 
 
 
402 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  39.03 
 
 
401 aa  299  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
398 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  40.85 
 
 
398 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.87 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
374 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
393 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  29.84 
 
 
367 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  61.79 
 
 
306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
397 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.78 
 
 
410 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
403 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  39.02 
 
 
206 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.5 
 
 
399 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  29 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
389 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
414 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.61 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.01 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.06 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  20.88 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  20.87 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.47 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  20.32 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.19 
 
 
372 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
378 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 
345 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>