128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4324 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  73.49 
 
 
429 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  77.19 
 
 
432 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  77.19 
 
 
432 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  97.24 
 
 
435 aa  878    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  93.06 
 
 
447 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  77.19 
 
 
432 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  94.69 
 
 
431 aa  847    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  100 
 
 
434 aa  904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  55.1 
 
 
426 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  55.1 
 
 
426 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  52.12 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  48.94 
 
 
421 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  46.59 
 
 
433 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  48.15 
 
 
437 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  48.15 
 
 
420 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  48.76 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  48.76 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  48.76 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  46.1 
 
 
421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
421 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  47.77 
 
 
420 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
418 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  47.39 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  46.85 
 
 
444 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  44.58 
 
 
437 aa  351  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  42.93 
 
 
390 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  40.1 
 
 
388 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  42.44 
 
 
400 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.9 
 
 
402 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  40.7 
 
 
402 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  40.56 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
398 aa  279  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
398 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
395 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  31.01 
 
 
393 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.5 
 
 
410 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  30.05 
 
 
429 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  28.5 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.79 
 
 
378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  52.89 
 
 
306 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
367 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
403 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  35.96 
 
 
206 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
391 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
368 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
387 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
399 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.06 
 
 
389 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.78 
 
 
378 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  22.72 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  21.53 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  21.9 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  22.59 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  22.59 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  22.91 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.64 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  21.2 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  20.78 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  22.98 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
357 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.45 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
395 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.08 
 
 
409 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.97 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  20.9 
 
 
394 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  21.7 
 
 
413 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  20.72 
 
 
386 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  20.31 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  21.7 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>