123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0606 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  76.31 
 
 		 437 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  72.17 
 
 		 444 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  55.81 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  49.88 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  49.88 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  50.25 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  49.37 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  47.9 
 
 		 435 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  48.15 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  48.15 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  47.49 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  47.49 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  47.41 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  47.49 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  45.02 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  42.79 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  42.79 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  43.1 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  42.79 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  42.54 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  42.54 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  42.36 
 
 		 420 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  42.25 
 
 		 420 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  41.5 
 
 		 418 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  39.57 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  37.27 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  38.86 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  38.11 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  38.21 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  36.58 
 
 		 398 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  36.87 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  35.17 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  36.45 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.44 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.08 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  35.27 
 
 		 206 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22.91 
 
 		 392 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  21.96 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.61 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  21.31 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  21.04 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  21.04 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  21.47 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.1 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.8 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  21.48 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  21.8 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  20.83 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  26.94 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.52 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>