123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3313 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  100 
 
 		 428 aa  889    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  59.52 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  59.52 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  54.33 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  54.33 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  54.33 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  52.72 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  52 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  52.36 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  52.12 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  51.33 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  48.83 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  49.37 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  49.62 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  49 
 
 		 437 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  46.67 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  45.95 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  47.19 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  46.45 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  44.24 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  44.52 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  43.53 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  43.53 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  43.53 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  44.83 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  44.04 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  53.77 
 
 		 306 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  43.59 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  43.35 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  40.94 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  41.67 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  41.71 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  40.91 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.21 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  31.03 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 395 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  31.96 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 367 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 391 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  41.95 
 
 		 206 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  25 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.51 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.06 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  20.79 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  20.3 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  29.13 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.17 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.03 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.7 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.7 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.85 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  20.87 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.83 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  20.6 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  20.44 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  20.54 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  23.3 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.26 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  20.27 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>