132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0904 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  100 
 
 
437 aa  915    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  58.41 
 
 
444 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  57.37 
 
 
437 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  55.81 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  49 
 
 
428 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
426 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
426 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  46.19 
 
 
429 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  45.1 
 
 
432 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  45.1 
 
 
432 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  45.1 
 
 
432 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  45.57 
 
 
447 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  43.74 
 
 
435 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  43.46 
 
 
431 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  44.58 
 
 
434 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  43.35 
 
 
433 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  43.35 
 
 
421 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  41.63 
 
 
421 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  41.42 
 
 
420 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  41.42 
 
 
420 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  41.42 
 
 
420 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  40.44 
 
 
420 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  40.2 
 
 
421 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  40.69 
 
 
420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  39.11 
 
 
388 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.58 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
418 aa  308  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  38.66 
 
 
401 aa  289  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  39.36 
 
 
400 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  39.12 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  35.85 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  35.22 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  33.87 
 
 
402 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
391 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
393 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
391 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
387 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
397 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
367 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  44.96 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.74 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.51 
 
 
410 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.11 
 
 
429 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  34.8 
 
 
206 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
399 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
389 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
362 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
395 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
372 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
441 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.12 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.9 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.06 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.28 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.9 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  21.63 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  21.94 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  21.87 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.57 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.1 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.91 
 
 
629 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  20.1 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  21.98 
 
 
378 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  20.85 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  20.85 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  20.54 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  21.82 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.48 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.26 
 
 
342 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  18.41 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  21.58 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>