131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1976 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  76.31 
 
 
437 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  100 
 
 
437 aa  907    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  72.27 
 
 
444 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  57.37 
 
 
437 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  51.52 
 
 
426 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  51.52 
 
 
426 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  48.83 
 
 
428 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  47.89 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  47.89 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  47.89 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  48.01 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  47.39 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  47.39 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  47.15 
 
 
435 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  47.15 
 
 
431 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  44.94 
 
 
420 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  44.69 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  43.1 
 
 
421 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  43.07 
 
 
433 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
420 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  42.12 
 
 
421 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  42.82 
 
 
421 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
400 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.58 
 
 
402 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
388 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  38.14 
 
 
401 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  38.92 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  38.27 
 
 
398 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  36.22 
 
 
402 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  37.47 
 
 
398 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  39.02 
 
 
306 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.32 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
397 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
403 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  28.27 
 
 
391 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
367 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
378 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.25 
 
 
410 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
368 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  34.3 
 
 
206 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
395 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
390 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
390 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
390 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
389 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
405 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
372 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
378 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
414 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
396 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
409 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
394 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.86 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.74 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
400 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.01 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.6 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
386 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.72 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
372 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
413 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.79 
 
 
365 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.19 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>