168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1795 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  100 
 
 
367 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  52.72 
 
 
378 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  30.91 
 
 
410 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  30 
 
 
374 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  29.58 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  30.75 
 
 
368 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
428 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
426 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
426 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
388 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
437 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  26.85 
 
 
437 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
402 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.61 
 
 
399 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
414 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
432 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
432 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
432 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
431 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
378 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
433 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
420 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
420 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
420 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
434 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
421 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
421 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.13 
 
 
398 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
447 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
444 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
390 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.58 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
437 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
441 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
391 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
418 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
397 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
372 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.63 
 
 
362 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.45 
 
 
392 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
404 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
320 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
351 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.07 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  22.74 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.22 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
398 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.64 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.64 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  21.33 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.91 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  24.6 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.39 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.55 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25.68 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.15 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>