176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5726 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  100 
 
 		 326 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  74.54 
 
 		 326 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  73.46 
 
 		 325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  58.05 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  51.52 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  46.99 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  49.66 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  44.91 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  43.71 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  41.98 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  40.73 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  40.37 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  41.49 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  38.81 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  34.49 
 
 		 358 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  39.64 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  34.31 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  33.43 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  33.63 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  31.88 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.35 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  29.47 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.85 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.27 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.62 
 
 		 381 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.6 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.65 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.94 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  30.83 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.35 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.33 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.73 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.68 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  26.18 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.59 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.08 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.3 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.17 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.37 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.96 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.85 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.37 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  24.84 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  24.84 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.22 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.67 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  25.75 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>