111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2419 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  94.37 
 
 
390 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  94.37 
 
 
390 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  94.24 
 
 
405 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  94.37 
 
 
390 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  100 
 
 
395 aa  819    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  41.16 
 
 
389 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.34 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
391 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
437 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
400 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
444 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  21.66 
 
 
378 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.1 
 
 
402 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
388 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
397 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
391 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
429 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
401 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  22.85 
 
 
437 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
372 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  21.22 
 
 
435 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  22.45 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  20.98 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.37 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  20.47 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  21.26 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  21.28 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.09 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  20.83 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  21.47 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.23 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.99 
 
 
342 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  22.06 
 
 
336 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.38 
 
 
358 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.97 
 
 
365 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.45 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  22 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  22 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.3 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.25 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  20.98 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  21.76 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
396 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
339 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>