110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0313 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  100 
 
 		 410 aa  851    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  62.85 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  32.07 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  32.23 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  32.01 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  28.71 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.17 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  24.37 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.04 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.8 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  22.79 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  22.25 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.3 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  22.04 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  21.1 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.17 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  21.92 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  20.31 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  20.31 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.66 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  21.64 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  18.61 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  21.59 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  19.87 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  19.87 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  19.87 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  21.31 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  19.69 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  21.82 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  23.94 
 
 		 361 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>