116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2729 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  100 
 
 
420 aa  875    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  100 
 
 
420 aa  875    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  94.95 
 
 
421 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  100 
 
 
420 aa  875    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  94.29 
 
 
420 aa  831    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  76.44 
 
 
420 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  75 
 
 
418 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  55.42 
 
 
421 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  54.87 
 
 
433 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  55.18 
 
 
421 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  48.92 
 
 
429 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  48.29 
 
 
447 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  48.29 
 
 
431 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  48.76 
 
 
434 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  45.43 
 
 
426 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  45.43 
 
 
426 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  43.53 
 
 
428 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  42.79 
 
 
437 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  42.79 
 
 
444 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  41.42 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  38.48 
 
 
388 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.43 
 
 
402 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
400 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  38.08 
 
 
390 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
401 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
402 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
398 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
395 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
403 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.35 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.57 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
367 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
393 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
391 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
378 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
372 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  43.7 
 
 
306 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  31.9 
 
 
206 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
399 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
362 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
389 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.92 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  21.58 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  21.58 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  21.58 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.11 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.6 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  22.82 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.87 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  21.6 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.64 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  22.01 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  19.52 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  22.01 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  19.83 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  19.9 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  20.39 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  19.74 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  21.04 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  20.39 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
336 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
336 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  21 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  20.85 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.84 
 
 
345 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.19 
 
 
337 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
357 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  19.83 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  24.57 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  20.54 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
351 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  19.44 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  19.44 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>