131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3524 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  100 
 
 
398 aa  806    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  82.41 
 
 
398 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  46.88 
 
 
402 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  40.85 
 
 
426 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  40.85 
 
 
426 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  39.2 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
434 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  40.91 
 
 
428 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
429 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
447 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  38.56 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  38.87 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  38.27 
 
 
437 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  38.14 
 
 
401 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  38.13 
 
 
400 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  37.8 
 
 
402 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  38.61 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  37.53 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  36.44 
 
 
433 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
432 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
432 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
432 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  36.87 
 
 
437 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
444 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
421 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  35.85 
 
 
437 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  34.76 
 
 
421 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
420 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
420 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
420 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
420 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  33.78 
 
 
421 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  41.55 
 
 
206 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
395 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
397 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  30.87 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
403 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  30.24 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.13 
 
 
367 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.27 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
378 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
374 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
378 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  50 
 
 
306 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
391 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
429 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
372 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
396 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
389 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  26.68 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  26.68 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
396 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
392 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  29.22 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.39 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.05 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.41 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  24.06 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>