53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6370 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  41.55 
 
 		 398 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  40.58 
 
 		 398 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  41.95 
 
 		 428 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.83 
 
 		 402 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  38.54 
 
 		 421 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  39.02 
 
 		 426 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  39.02 
 
 		 426 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  37.75 
 
 		 421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  36.95 
 
 		 390 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  37.44 
 
 		 435 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  35.78 
 
 		 433 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  36.45 
 
 		 431 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  36.45 
 
 		 447 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  36.76 
 
 		 429 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 434 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  34.95 
 
 		 432 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  34.95 
 
 		 432 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  34.95 
 
 		 432 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  35.44 
 
 		 388 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  34.63 
 
 		 401 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  37.2 
 
 		 444 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  33.65 
 
 		 400 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 402 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  35.27 
 
 		 437 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  34.8 
 
 		 437 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 437 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 420 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 420 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 420 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 421 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 420 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  31.52 
 
 		 418 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 393 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  33.83 
 
 		 395 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  40.78 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  30.17 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  30.5 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  32.68 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 367 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  30.17 
 
 		 399 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 372 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.34 
 
 		 410 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 378 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 429 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  35.04 
 
 		 441 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>