155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6846 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  100 
 
 
401 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  52.11 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  43.88 
 
 
400 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  41.96 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  43.59 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  42 
 
 
390 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  41.33 
 
 
435 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  38.14 
 
 
437 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  38.11 
 
 
437 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  39.03 
 
 
426 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  39.03 
 
 
426 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  40.82 
 
 
447 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  40.82 
 
 
431 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  39.39 
 
 
429 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
432 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
432 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
432 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  38.36 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  38.4 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  40.56 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  36.22 
 
 
433 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  38.82 
 
 
398 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
421 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  38.14 
 
 
398 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  34.61 
 
 
420 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  33.93 
 
 
418 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
420 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
420 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
420 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  35.46 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  33.76 
 
 
421 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  33.17 
 
 
420 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
395 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
391 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
391 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
393 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
403 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
391 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.71 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
374 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.08 
 
 
378 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
367 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.57 
 
 
410 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  46.4 
 
 
306 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
387 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  34.63 
 
 
206 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.74 
 
 
429 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
399 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
395 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
372 aa  97.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
362 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.2 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  21.33 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.38 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  21.95 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.9 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  21.95 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.2 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.8 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  21.19 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.6 
 
 
323 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.18 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.57 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
331 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  21.92 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  23.46 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.48 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  21.91 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.3 
 
 
342 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  21.32 
 
 
415 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.19 
 
 
629 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>