119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0583 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  75 
 
 
420 aa  678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  75 
 
 
420 aa  678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  74.76 
 
 
421 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  75 
 
 
420 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  74.4 
 
 
420 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  92.31 
 
 
420 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  100 
 
 
418 aa  865    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  57.77 
 
 
421 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  57.77 
 
 
433 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  56.07 
 
 
421 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  48.52 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  48.52 
 
 
435 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  48.03 
 
 
431 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
434 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  48.03 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  46.6 
 
 
426 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  46.6 
 
 
426 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  47.19 
 
 
428 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  44.69 
 
 
437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  41.5 
 
 
437 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  43.67 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
437 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.53 
 
 
402 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  38.12 
 
 
388 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  39.28 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  38.61 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  38.07 
 
 
398 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  33.93 
 
 
401 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.5 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
393 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
397 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.06 
 
 
410 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
391 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
429 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
367 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
374 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
391 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
378 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
372 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
362 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
378 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
387 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  31.52 
 
 
206 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.41 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.99 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.25 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.71 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.9 
 
 
372 aa  63.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.49 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.49 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.1 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.3 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  21.91 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  21.92 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  21.92 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  20.41 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.67 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.52 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  20.15 
 
 
409 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  20.15 
 
 
409 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
336 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
339 aa  53.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
336 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>