135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3745 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  73.86 
 
 
429 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  100 
 
 
432 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  100 
 
 
432 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  77.19 
 
 
435 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  78.7 
 
 
447 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  100 
 
 
432 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  77.55 
 
 
431 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  77.19 
 
 
434 aa  715    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  57.69 
 
 
426 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  57.69 
 
 
426 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  54.33 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  47.73 
 
 
421 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  46.65 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  48.15 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  47.49 
 
 
437 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
420 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  48.27 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  47.89 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  48.28 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  46.6 
 
 
444 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  45.1 
 
 
437 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  42.64 
 
 
390 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  40.73 
 
 
388 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  42.97 
 
 
400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  39.53 
 
 
402 aa  297  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
401 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  38.24 
 
 
402 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
398 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
398 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  38.64 
 
 
306 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  30.85 
 
 
393 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  29.2 
 
 
374 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.75 
 
 
391 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
378 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
397 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  34.95 
 
 
206 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
387 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
429 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
391 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
378 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
389 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.68 
 
 
362 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
414 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.28 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.84 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  21.95 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.52 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  20 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  21.72 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  21.72 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
353 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  21.96 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
358 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.52 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  21.72 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
351 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>