140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4123 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  100 
 
 
409 aa  853    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  72.24 
 
 
413 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  72.63 
 
 
413 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  46.25 
 
 
409 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  46.25 
 
 
409 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  45.66 
 
 
396 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  46.25 
 
 
409 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  46.02 
 
 
409 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  44.3 
 
 
396 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  45.04 
 
 
396 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  44.68 
 
 
392 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  45.45 
 
 
409 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  44.62 
 
 
394 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  44.01 
 
 
392 aa  362  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  43.97 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  42.75 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  42.23 
 
 
396 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  42.23 
 
 
396 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  42.23 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  41.97 
 
 
396 aa  332  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  40.78 
 
 
395 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  35.58 
 
 
404 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  36.02 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  34.53 
 
 
415 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
408 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
401 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
401 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  33 
 
 
399 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
398 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
404 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
410 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  28.75 
 
 
397 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
391 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.68 
 
 
391 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  23.24 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
362 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.5 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.74 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.64 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.22 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  24.06 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.7 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.98 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  22.88 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  21.75 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  20.32 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  20.32 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  19.84 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  19.34 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  20.44 
 
 
444 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  21.02 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  21.08 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  21.8 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  21.45 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  20.81 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.6 
 
 
351 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  19.52 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  19.52 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  19.52 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  19.62 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
395 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  20.44 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.95 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.28 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>