112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2069 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  100 
 
 		 395 aa  809    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  46.95 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  46.91 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  47.41 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  48.46 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  47.81 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  47.03 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  46.68 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  46.68 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  47.06 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  46.43 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  46.68 
 
 		 409 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  42.67 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  42.42 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  42.16 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  41.9 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  41.9 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  43.04 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  40.78 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  41.69 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  41.01 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  40.05 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  42.28 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  37.69 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  37.97 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  37.63 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  33.59 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  30.6 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.31 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.27 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  25.83 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.43 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.22 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.87 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.69 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  25.34 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  20.86 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.05 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.02 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>