77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3654 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  100 
 
 		 426 aa  851    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  24.34 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  29.5 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  24.73 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  22.83 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  21.54 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  23.02 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  21.55 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  21.23 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>