119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6907 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  100 
 
 
398 aa  836    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  62.85 
 
 
410 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
404 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  33 
 
 
404 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
409 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  30.5 
 
 
396 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  29.64 
 
 
413 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  29.16 
 
 
413 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  31.94 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  32.18 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
408 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
401 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
401 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  29.98 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  30.35 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
396 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
396 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  29.85 
 
 
396 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
396 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
396 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
392 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
400 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
409 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
409 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
409 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  29.59 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
378 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
391 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
391 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.66 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
362 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
388 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
374 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
403 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  20.46 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.79 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  21.61 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  21.61 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  23.84 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  21.25 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  21.55 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  21.38 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  20.78 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  20.78 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  22.81 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.66 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.62 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.29 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  19.7 
 
 
447 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  21.27 
 
 
399 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  19.7 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.41 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  19.19 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  19.19 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  19.19 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.73 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  23.63 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.33 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  20.27 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>