149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4034 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  100 
 
 
396 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  68.88 
 
 
396 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  67.71 
 
 
392 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  66.93 
 
 
392 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  66.24 
 
 
394 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  66.92 
 
 
396 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  63.05 
 
 
396 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  62.53 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  62.53 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  60.15 
 
 
409 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  62.27 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  61.86 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  57.91 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  57.91 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  58.61 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
409 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  57.14 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  48.46 
 
 
395 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  45.66 
 
 
409 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  46.25 
 
 
413 aa  359  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  45.22 
 
 
413 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  38.72 
 
 
404 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  39.65 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  38.85 
 
 
415 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
401 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  41.03 
 
 
392 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
401 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
401 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  33.5 
 
 
399 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  35.75 
 
 
404 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.5 
 
 
398 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.12 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
391 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
362 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
391 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
403 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
429 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
444 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
429 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.87 
 
 
410 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.74 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
426 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
421 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.74 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  25 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.77 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.22 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  22.56 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.19 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  22.82 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  22.82 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
390 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  22.82 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  24.25 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.75 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  22.2 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  27.33 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
441 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>