175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0594 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  70.11 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  68.98 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  45.51 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  45.4 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  30.31 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 312 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.83 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.05 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.15 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.04 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  30.9 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.51 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 319 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.35 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  27.68 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.27 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  28.2 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 334 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 351 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  34.03 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.35 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  24.85 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.09 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.88 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.29 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.34 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.41 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.51 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.18 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  27.17 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.7 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.01 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  28 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  29.71 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  28.96 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>