148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5212 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 333 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  74.54 
 
 		 334 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  72.04 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  68.29 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  67.78 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  53.39 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  59.04 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.78 
 
 		 629 aa  361  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  50.76 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.29 
 
 		 323 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  50.61 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  34.24 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.58 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.52 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.69 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.8 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.63 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  32.72 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.53 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.87 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.31 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.89 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.33 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  30.21 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.47 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  30.03 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.81 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  28.61 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.05 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25.17 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.69 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.64 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.09 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  20.07 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.38 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.38 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.78 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  21.78 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  22.22 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  20.42 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  23.02 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  23.8 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>