189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1036 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  100 
 
 
340 aa  695    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  46.2 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  42.59 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  41.82 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  40.06 
 
 
320 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  40.36 
 
 
331 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  36.83 
 
 
336 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  36.83 
 
 
336 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  40.24 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  41.49 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  39.64 
 
 
326 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
326 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  36.78 
 
 
358 aa  206  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  39.16 
 
 
336 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  40.6 
 
 
351 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  40.4 
 
 
297 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  37.04 
 
 
339 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  36.69 
 
 
325 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  40.14 
 
 
330 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  35.88 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  34.14 
 
 
331 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  33.82 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  34.64 
 
 
337 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  28.1 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
336 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.77 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  29.06 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  31.07 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  30.18 
 
 
316 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.25 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.27 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  27.56 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.92 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.31 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
366 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.88 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.13 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.57 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.62 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  27.24 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.43 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.35 
 
 
629 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.18 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.93 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.37 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  23.08 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.73 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  26.27 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.57 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.92 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  24.02 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.39 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.17 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.09 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  23.4 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>