129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2293 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  100 
 
 
312 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  53.02 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  34.1 
 
 
354 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.68 
 
 
323 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  38.43 
 
 
339 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.48 
 
 
350 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.55 
 
 
342 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  35.54 
 
 
345 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
336 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  32.89 
 
 
361 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.29 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.8 
 
 
629 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.67 
 
 
342 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
358 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.08 
 
 
341 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.21 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.61 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
334 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
364 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.47 
 
 
351 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.13 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.2 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  32.35 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  29.96 
 
 
364 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  28.57 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.8 
 
 
333 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
358 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
313 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
335 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
353 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.47 
 
 
330 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.68 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  31.56 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.63 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  32.92 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  31.4 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  29.06 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.75 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  31.28 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.42 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.16 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  25.5 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.55 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  23.25 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25.48 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  30.7 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.62 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.33 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.51 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.68 
 
 
410 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
398 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
367 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  21.05 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
387 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
386 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  22.07 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.45 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>