157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4292 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  100 
 
 		 331 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  65.31 
 
 		 320 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  52.85 
 
 		 336 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  45.12 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  42.77 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  40.92 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  40.73 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  41.54 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  42.94 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  43.9 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  43.73 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  38.77 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  40.36 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  42.31 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  35.14 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  36.92 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  35.84 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  34.74 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.52 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.06 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.52 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.33 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.1 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.28 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32.85 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.27 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.52 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.98 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.71 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  31 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.48 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.94 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.5 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.75 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.46 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.46 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.43 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.81 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.82 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.1 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  25.98 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.64 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  21.09 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>