130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5604 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  100 
 
 
336 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  56.85 
 
 
338 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  29.92 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.46 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.04 
 
 
372 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
313 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 
356 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
326 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  31.29 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
336 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
320 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
326 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
326 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.09 
 
 
383 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
316 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.94 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
358 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
330 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
319 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
315 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
350 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
336 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
336 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  29.93 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.75 
 
 
312 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.66 
 
 
364 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.66 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.71 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
367 aa  96.3  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.55 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.28 
 
 
364 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.06 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.73 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.2 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.84 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.49 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.12 
 
 
337 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.43 
 
 
629 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.34 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.36 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.76 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.91 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.29 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.2 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.09 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.09 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.03 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.29 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.46 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
283 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  23.46 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  24.59 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  23.38 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  21.05 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.32 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  23.63 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  22.65 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.77 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  28.69 
 
 
409 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>