111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03238 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  100 
 
 		 340 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  74.41 
 
 		 339 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  72.06 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  66.07 
 
 		 349 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  64.58 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  67.35 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  66.37 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  66.18 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  66.08 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  65.59 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  66.76 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  66.96 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  65.4 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  65.1 
 
 		 342 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  65.4 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  64.91 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  65.2 
 
 		 342 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  65.1 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  64.52 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  64.12 
 
 		 341 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  65.98 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  63.56 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  64.62 
 
 		 345 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  62.46 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  62.65 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  59.82 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  55.07 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  38.44 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  37.2 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  34.71 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.51 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.81 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.66 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.51 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  32.93 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.47 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.15 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.39 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.65 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  21.57 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  24.65 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.3 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.18 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  21.75 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  21.94 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  23.02 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.17 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.04 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.18 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  21.71 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.91 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>