123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1753 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  100 
 
 		 333 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.43 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.73 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  36.94 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.88 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.13 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.06 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.04 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  38.04 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  35.38 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  31.14 
 
 		 629 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.44 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32.3 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.01 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  31.74 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.12 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.97 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.25 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.38 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.97 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.41 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.8 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.53 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  27.24 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  29.51 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.57 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  24.22 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.59 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  20.62 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.29 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.91 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  20.89 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  21.05 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.38 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  25.37 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 435 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 437 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.78 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  21.88 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.73 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>