201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3785 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  100 
 
 		 320 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  65.31 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  57.86 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  46.6 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  45.23 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  42.77 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  41.98 
 
 		 326 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  43.87 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  46.58 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  41.1 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  41.1 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  41.55 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  40.06 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  39.76 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  37.93 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  38.08 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  35.45 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  36.59 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  36.86 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  36.51 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  31.66 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  31.66 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  36.01 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  31.41 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.1 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.42 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.53 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.66 
 
 		 629 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.86 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.26 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.54 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.13 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  28.62 
 
 		 381 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  34.03 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  34.44 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.47 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.91 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.31 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  29.28 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.21 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.91 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.67 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.97 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  28.69 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.38 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.37 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.41 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.06 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  27.98 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>