140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3061 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  100 
 
 
330 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  86.2 
 
 
297 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  64.33 
 
 
330 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  50.61 
 
 
339 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  46.99 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  46.81 
 
 
325 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  46.2 
 
 
326 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  48.79 
 
 
326 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  41.1 
 
 
320 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  42.94 
 
 
331 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  42.11 
 
 
338 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  41.69 
 
 
336 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
317 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  38.44 
 
 
340 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
358 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
336 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
336 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  34.25 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  33.43 
 
 
326 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  34.35 
 
 
351 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
337 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.91 
 
 
345 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  30.32 
 
 
361 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.78 
 
 
339 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
336 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.37 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.33 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  31.98 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  31.48 
 
 
361 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.12 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
372 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.43 
 
 
629 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.9 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.73 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.66 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.51 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.34 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.27 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.41 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.38 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.41 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  29.83 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.84 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.35 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  33.73 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.74 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.5 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
401 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
353 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.36 
 
 
358 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.49 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  24.68 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
396 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  25.77 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
362 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  29.35 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.85 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
398 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
393 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
397 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
396 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>