113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3915 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  100 
 
 		 353 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  60.81 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  58.62 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  60.53 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  59.37 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  58.58 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  58.43 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  57.85 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  55.49 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  55.07 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  54.94 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  54.65 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  54.36 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  54.49 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  54.36 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  57.27 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  54.84 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  54.49 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  54.07 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  57.27 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  55.65 
 
 		 341 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  56.1 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  55.07 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  53.49 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  55.52 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  54.07 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  54.28 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  36.09 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  35.19 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  34.97 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  35.38 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.66 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.34 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.04 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25.09 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.38 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.79 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.16 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  24.8 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  26 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  21.05 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.77 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.46 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.05 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 316 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  24.82 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.82 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.46 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  24.75 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  23.44 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  21.3 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.19 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  22.1 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.41 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>