92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2314 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  93.12 
 
 		 349 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  100 
 
 		 349 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  67.35 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  66.07 
 
 		 340 aa  484  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  66.77 
 
 		 342 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  65.29 
 
 		 342 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  65.37 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  65.58 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  65 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  65.28 
 
 		 342 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  64.12 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  63.82 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  66.18 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  64.41 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  66.47 
 
 		 341 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  63.27 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  64.83 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  62.94 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  66.18 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  65.89 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  63.61 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  63.24 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  64.09 
 
 		 343 aa  457  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  64.12 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  61.83 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  58.81 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  59.37 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  38.99 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  37.57 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  35.82 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.88 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.73 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.17 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.45 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.41 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.91 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.55 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.7 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  41 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.58 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  24 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 270 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  40 
 
 		 282 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.21 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  21.28 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  22.22 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 350 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  22.15 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.55 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  22.48 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>