168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2061 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  100 
 
 		 326 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  74.54 
 
 		 326 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  73.46 
 
 		 325 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  57.14 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  51.96 
 
 		 339 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  46.2 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  48.31 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  46.6 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  43.32 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  42.65 
 
 		 338 aa  258  9e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  42.77 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  41.85 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  43.08 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  37.98 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  33.97 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  34.43 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  33 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  33 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  30.24 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 353 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.55 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  35 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  29.09 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.62 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.89 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  27.38 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.92 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 372 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.41 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.38 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.34 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.78 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  29.48 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.52 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.28 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.8 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.83 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.71 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.7 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.25 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  24.84 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  26.06 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.04 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  25.49 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.65 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.97 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  25 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.22 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.23 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.87 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>