118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7137 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  100 
 
 
350 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  38.31 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.92 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.74 
 
 
339 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.74 
 
 
350 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  32.54 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
337 aa  115  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
358 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.55 
 
 
383 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
358 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.21 
 
 
342 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
335 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
312 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
315 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.63 
 
 
346 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
331 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.86 
 
 
351 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.5 
 
 
354 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
336 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
323 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  30 
 
 
325 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  28.03 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
333 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.6 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
351 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.41 
 
 
629 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  31.64 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.83 
 
 
339 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.07 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
326 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.29 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.1 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.16 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  29.53 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  29.27 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.74 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  32.7 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.92 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  29.62 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  27.13 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.75 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.49 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.67 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.27 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.09 
 
 
282 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.82 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.07 
 
 
365 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.96 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.75 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
395 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  22.73 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.86 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.88 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.39 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  22.87 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  22.9 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  29.65 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  22.56 
 
 
429 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  20.98 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.48 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>